玛纳斯县博物馆建筑总面积4840平方米，其中展厅面积2100平方米。目前，博物馆共举办了四个固定展览，一层是《玛河魂》展厅，主要是以玛纳斯河为主线，展出玛纳斯县“中国碧玉之都”、“国家湿地公园”、“国家森林公园”、“国际葡萄酒庄”四张名片，还有《玛纳斯县家风家训馆》；二层是《玛纳斯历史文物陈列展》，主要是以历史为脉络，展0示玛纳斯县各个历史时期的文物；三层是《玛纳斯国防教育展》和《清风馆》。
玛纳斯县博物馆新馆于2011年11月建成，2012年开始布展，2014年12月正式开馆，博物馆布展投入资金1175万元（县级财政投入1075万元，争取上级资金100万元），玛纳斯博物馆建筑总面积4839.68平方米（地下一层、一层、二层、三层分别为1361.94、1361.94、1057.9、1057.9平方米），展厅面积2077.61平方米（一层、二层、三层分别为721.79、677.91、677.91平方米），展线长度606.24米（一层、二层、三层分别为225.6、190.32、190.32米），现有展览《玛河魂》、《玛纳斯历史文物陈列展》、《玛纳斯国防教育展》、《玛纳斯家风家训馆》四个固定展览，另有《玛纳斯清风馆》一个临时展览，博物馆藏品总数1526件。玛纳斯博物馆库房面积389平方米，位于地下一层。
